康奈尔大学系统工程系(Department of Systems Engineering)研究生开设有以下两种学位项目，分别是：
系统工程硕士(M.Eng in Systems Engineering)：为期1-1.5年，属于Professional项目，要求修读30-33个学分，分on-line和on-campus两种授课形式。要求申请者本科毕业，不限专业但最好拥有理工专业，拥有微积分、常微分方程等数学基础。此外，该项目还对概率论及统计学课程有要求。尚未有学习过此类课程的学生，入学后要求进行补修。该项目国际学生亦有机会获得奖学金。该项目已有15年历史，包含有多个专业方向
系统工程博士(PhD in Systems Engineering)：为期4-6年，属于Research项目，系2017秋季新开项目。本科生可以直接申请，无需硕士背景
康奈尔大学工业工程硕士项目开设有以下专业方向：
生物系统工程(Bio-Systems Engineering)
商业系统(Business Systems)
化学系统工程(Chemical Systems Engineering)
通信系统工程(Communications Systems Engineering)
控制与优化系统工程(Controls & Optimization Systems Engineering)
环境系统工程(Environmental Systems Engineering)
食品、农业与营养系统工程(Food/Agriculture/Nutrition Systems Engineering)
基建系统工程(Infrastructure Systems Engineering)
物流工程(Logistics Engineering)
机电一体化系统工程(Mechatronic Systems Engineering)
自然资源系统工程(Natural Resource Systems Engineering)
产品开发系统工程(Product Development Systems Engineering)
软件系统工程(Software Systems Engineering)
航空航天系统工程(Spacecraft/Aerospace Systems Engineering)
可持续发展系统工程(Sustainability Systems Engineering)
系统设计与优化(Systems Design and Optimization)
交通系统工程(Transportation Systems Engineering)
车辆系统工程(Vehicle Systems Engineering)
Web应用与信息工程(Web Applications and Information Engineering)
康奈尔大学系统工程博士的每一个研究方向，都属于交叉学科，都系与工程学院其它科系共同开设，如土木与环境工程系、机械与航空航天工程系等：
能源系统(Energy Systems)
环境与水资源(Environment and Water Resources)
食品系统(Food Systems)
健康系统(Health Systems)
制造系统(Manufacturing Systems)
空间系统(Space Systems)
系统设计与架构(Systems Design & Architecture)
交通系统(Transportation Systems)
